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Los aniones en el diésel, especialmente el biodiésel, pueden ocasionar depósitos perjudiciales en el motor. La determinación con cromatografía iónica requiere la transferencia de los aniones del diésel a una solución acuosa, inyectable al cromatógrafo iónico. Un método típico para transferir los aniones al agua es la extracción inline con una posterior diálisis inline antes de la inyección (consulte el correspondiente análisis de los cationes en la AN-C-101). En el método de eliminación de la matriz propiamente dicho, se inyecta diésel diluido con isopropanol en una corriente de isopropanol y se pasa a través de una columna de preconcentración. El isopropanol elimina el diésel, y un paso de enjuague posterior con agua ultrapura elimina el exceso de isopropanol.

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