Il perclorato nell'acqua proviene per lo più da fonti antropogeniche, quali fertilizzanti, fuochi d'artificio, combustibile per razzi ecc. L'analisi di tracce di perclorato in campioni di acqua è un compito difficile. L'elevato contenuto di anioni standard provoca grandi picchi che interferiscono con i picchi di perclorato molto piccoli. Con la tecnica Heart-Cut, la frazione di perclorato, in gran parte liberata dagli anioni che interferiscono, viene reiniettata nella colonna fornendo un picco nitido.