La taille de l’échantillon disponible, la sensibilité de masse, l’efficacité et le type de détecteur sont des critères importants dans le choix des dimensions de la colonne de séparation. Comparé aux colonnes classiques de 4 mm i.d., les colonnes microbores se distinguent, notamment, par leur faible consommation d’éluant. Une fois qu’un éluant est préparé, il peut être utilisé pendant une longue période. En outre, les vitesses d’écoulement inférieures des colonnes microbores facilitent la liaison avec les spectromètres de masse du fait de l’efficacité améliorée de l’ionisation dans la source ionique. Avec la même quantité d’échantillon injectée, un diamètre de colonne réduit de moitié implique un flux faible d’éluant et fournit une augmentation au quadruple de la sensibilité. Inversement, cela signifie qu’avec une quantité d’échantillon moindre, les colonnes microbores atteignent la même sensibilité et résolution chromatographiques que les colonnes bores normales. Elles sont ainsi idéales pour les échantillons en quantité disponible limitée.
