Como es sabido, se produce un pico de sistema en la cromatografía iónica sin supresión después de cada inyección de muestra. Lo mismo ocurre en el caso de la cromatografía iónica con supresión. Allí, el pico de sistema es normalmente más pequeño, pero a pesar de ello puede interferir con los iones que se desean determinar. En algunos casos, el operador ni siquiera reconoce que detrás de un pico de sistema está oculto el ion por determinar.
El origen del pico de sistema y los factores que determinan su área y posición todavía se debaten . Los dos efectos principales son:
- el pico de sistema coincide con la elución del anion del eluyente
- el área del pico de sistema depende de la matriz de la muestra
Si se conoce la posición del pico de sistema con varios tipos de columna, se puede seleccionar la columna adecuada para la aplicación.