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Bekanntlich kommt ein Systempeak in der nicht suppressierten Ionenchromatographie nach jeder Probeninjektion vor. Dasselbe gilt für die suppressierte Ionenchromatographie. Dort ist der Systempeak normalerweise viel kleiner, kann aber trotzdem mit den zu bestimmenden Ionen interferieren. In einigen Fällen erkennt der Operator nicht einmal, dass hinter einem Systempeak ein zu bestimmendes Ion verborgen ist.

Der Ursprung des Systempeaks sowie der Faktoren, welche seine Grösse und Lage beeinflussen, ist nach wie vor im Gespräch. Die zwei Haupteffekte sind:

- der Systempeak eluiert zur Elutionszeit des Eluenten-Anions
- die Grösse des Systempeaks hängt von der Probenmatrix ab

Kennt man die Lage des Systempeaks mit verschiedenen Säulentypen, ermöglicht dies die Selektion der zu ihrer Applikation passenden Säule.

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