Metoda se používá k definování čeho, jak a kdy se má něco provést a stanovit.
V SW MagIC Net je Metoda rozložena do čtyř oken.
“Devices” (zařízení) ukazují všechny přístroje a moduly s jejich parametry použité v metodě. Kliknutím na odpovídající ikonu se otevřou parametry této části a ty pak mohou být upravovány. Analýzu (“Analysis”) lze v tomto okně vytvořit také. "Přiřazení hardwaru", "Data acquisition" (záznam dat), a "Accessories" (příslušenství) se zde definují také. Okno "Evaluation – Components" má sekci Integration (integrace), Analysis Components (složky analýzy), Standards (standardy), Calibration (kalibrace), a Results (výsledky). V "Results", je možné definovat "User-defined results" (výsledky definované uživatelem), "Statistics" (statistika), "Monitoring" (monitorování), atd. Třetí okno metody, časový program ("Time program") definuje přesný průběh analýzy, tedy všechny kroky, které musí IC systém nebo MagIC Net provést. Časový program může zahrnovat několik málo po sobě jdoucích kroků nebo komplexní prokládání subprogramů. Čtvrté okno ukazuje poslední chromatogram s aktuální kalibrací.